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Plant Journal | DAP-seq助力揭示紫花苜蓿MsMYB35調(diào)控花藥發(fā)育的分子機制

來源:藍景科信河北生物科技有限公司   2025年06月16日 14:47  

研究背景

紫花苜蓿(Medicago sativa L.)作為全球重要的優(yōu)質(zhì)牧草之一,其雜交育種對提升產(chǎn)量和品質(zhì)至關(guān)重要。然而,作為異花授粉的異源四倍體作物,苜蓿的基因組復雜性使其雄性不育的分子機制長期成謎。花藥發(fā)育作為植物生殖的核心過程,涉及絨氈層分化、花粉壁形成等精密環(huán)節(jié),而MYB家族轉(zhuǎn)錄因子在擬南芥等模式植物中已被證實為關(guān)鍵調(diào)控因子,但在苜蓿中仍未得到充分研究。

文獻解讀

2025317日,吉林農(nóng)業(yè)大學徐博教授團隊在Plant Journal發(fā)表了題為“Anther-specific expression of MsMYB35 transcription factor in alfalfa (Medicago sativa L.) and its crucial role in pollen development”的研究論文。該研究聚焦紫花苜蓿中MsMYB35基因,借助DAP-seq技術(shù)在全基因組范圍內(nèi)鎖定其結(jié)合位點,揭示了該基因通過茉莉酸信號通路和細胞壁重塑通路調(diào)控花藥發(fā)育的分子機制,為解析苜?;ㄋ幇l(fā)育的調(diào)控機制及分子育種提供理論依據(jù)。

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技術(shù)路線

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研究結(jié)果

研究發(fā)現(xiàn),紫花苜蓿MsMYB35基因在花藥中表達量顯著高于根、莖、葉,且在雄性不育系MSJN1A的小孢子母細胞和四分體時期表達量低于保持系MSJN1B。原位雜交顯示,該基因轉(zhuǎn)錄本從小孢子母細胞期至成熟花粉期存在于小孢子與絨氈層細胞,推測在花藥發(fā)育早期(尤其四分體時期)起重要作用。MsMYB35屬于R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子家族,其N端含經(jīng)典R2R3結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,MsMYB35與蒺藜苜蓿(MtMYB35)、大豆(GmMYB35)等物種的同源蛋白進化關(guān)系密切,功能保守,可能參與花藥發(fā)育和花粉形成。亞細胞定位顯示其定位于細胞質(zhì)和細胞核(以核膜為主),表明其可能通過調(diào)控核內(nèi)轉(zhuǎn)錄及胞質(zhì)過程參與花藥發(fā)育調(diào)控。

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圖1. MsMYB35基因表達分析。

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圖2. 紫花苜蓿MsMYB35的氨基酸序列比對與系統(tǒng)發(fā)育分析。

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圖3. MsMYB35亞細胞定位分析。

為研究MsMYB35轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制,作者通過DAP-seq鑒定出MsMYB35在基因組中的14,992個結(jié)合峰,其中8,097個高可靠性位點主要分布于基因間區(qū)(62.7%)和啟動子區(qū)(16.6%),富集到AAAAA、TAAC、GA(A/G)三類保守基序,對應3,647個靶基因。GO富集分析顯示,這些基因富集于植物激素信號轉(zhuǎn)導花發(fā)育調(diào)控等生物過程。結(jié)合RNA-seq數(shù)據(jù),篩選出467個直接調(diào)控基因(261個正調(diào)控、207個負調(diào)控)。KEGG富集分析顯示,其顯著富集于苯丙烷代謝、茉莉酸(JA)合成、細胞壁重塑(如果膠裂解酶通路)等與花藥發(fā)育密切相關(guān)的代謝途徑。進一步通過酵母單雜交(Y1H)和雙熒光素酶報告實驗證實MsMYB35可直接結(jié)合MsJMTMsPL的啟動子并激活其轉(zhuǎn)錄,表明其通過調(diào)控JA甲基轉(zhuǎn)移酶和果膠酸裂解酶影響花藥發(fā)育。外源MeJA處理實驗表明,不育系花藥發(fā)育缺陷可通過MeJA處理部分恢復,證實MsMYB35-JA通路在絨氈層發(fā)育和花粉成熟中的核心作用。

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圖4. 通過DAP-seq技術(shù)對MsMYB35結(jié)合位點進行的全基因組鑒定。

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圖5. RNA-seq與DAP-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析。

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圖6. MsMYB35靶向花藥發(fā)育相關(guān)基因啟動子。

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圖7. 不同發(fā)育階段花蕾中茉莉酸(JA)含量變化及對應花藥形態(tài)特征。

為進一步探究MsMYB35的功能,作者構(gòu)建了MsMYB35-OERNAi轉(zhuǎn)基因植株。RT-PCR顯示,MsMYB35-OE株系基因表達顯著上調(diào),RNAi株系則顯著下調(diào)。表型分析表明,過表達株系與野生型無明顯差異,而RNAi株系出現(xiàn)生長抑制、分枝減少、開花延遲等現(xiàn)象。組織學分析表明,RNAi植株在四分體階段即出現(xiàn)絨氈層結(jié)構(gòu)不連續(xù),單核期花粉液泡化,雙核期表皮破裂,成熟花粉無法形成。研究表明MsMYB35表達水平直接影響絨氈層發(fā)育、花粉壁形成及花藥開裂過程,其適當表達是花粉正常發(fā)育的必要條件,為解析苜蓿雄性不育機制及分子育種提供了關(guān)鍵依據(jù)。

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圖8. 轉(zhuǎn)基因苜蓿與野生型植株中MsMYB35基因的表達水平。

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圖9. 野生型和過表達MsMYB35紫花苜蓿不同發(fā)育階段的細胞學觀察。

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圖10. 苜?;ㄋ幇l(fā)育中MsMYB35的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。


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