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分享大型癌細胞株治療信息數(shù)據(jù)庫

時間:2017-11-1閱讀:146
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在發(fā)表的細胞株新研究論文中,Schreiber和Broad研究所的同事對這一門戶進行了描述,指出其中包含的信息是通過測量240種癌細胞系對于超過350種靶向細胞回路不同節(jié)點的化合物的反應而獲得。這些細胞系來自許多不同種類的腫瘤,另一項稱作為癌細胞系百科全書(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互補研究已經確定了這些細胞系的基因組特征。在美國國家癌癥研究所癌癥靶點發(fā)現(xiàn)和開發(fā)(CTD2)項目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共數(shù)據(jù),其中包含了有關每個癌細胞系突變、基因表達和其他基因組改變的信息。
Schreiber說:“CTRP和CCLE兩個項目顯著不同但又*地互補。兩者都是處于早期發(fā)展階段。隨著每個資源中數(shù)據(jù)的數(shù)量和多樣性不斷地增長,我們預計匹配患者與潛在有效藥物的能力將會大大地提高。”
Schreiber和同事們證明,研究中的這組化合物可以用來發(fā)現(xiàn)癌細胞系從前未檢測到的依賴性。隨著正常細胞一步步地變?yōu)榘┘毎?,它會累積大量的促癌遺傳改變,使得細胞能夠不受控制地分裂和存活。此外,在癌癥形成的過程中,其他通常在細胞中發(fā)揮無害作用的基因有可能變得對癌癥生存至關重要。通過讓細胞系暴露于不同的化合物中,研究人員能夠揭示癌細胞生存所必需的蛋白質,并有可能提供新的治療靶點。
Schreiber.說:“這些基因或許在癌癥早期階段沒有發(fā)揮內在作用,但隨著癌細胞形成,它會收編一些正常的蛋白質成為癌基因的伙伴。這就是我們真正想要揭露的:基因自身沒有被癌癥所改變,但卻與癌基因結合到了一起。這一門戶是揭示這些依賴性的一種好的途徑。”
在他們的論文中,Schreiber和同事們描述了一個如何利用CTRP來發(fā)現(xiàn)候選依賴性的例子。研究小組發(fā)現(xiàn)一種在細胞株肺癌臨床試驗中測試的藥物navitoclax,或許能夠尤其有效地靶向帶有CTNNB1突變的癌細胞系。CTNNB1突變存在于一些大腸癌、肝細胞癌、胃癌和子宮內膜癌中。這只是一個關于CTRP如何能夠幫助揭示有用生物標記物的例子,利用生物標記物可以預測藥物反應和耐藥。除了發(fā)現(xiàn)已開發(fā)藥物的新用途,CTRP還可用于鑒別新的治療靶點。
雷尼替丁相關物質A標準品    91224-69-0     50mg    
雷尼替丁相關物質B標準品    72126-78-4     50mg    
雷尼替丁相關物質C標準品    73851-70-4     50mg    
類姜黃素標準品        300mg    Curcuminoids
利巴韋林標準品    36791-04-5     200mg    Ribavirin 
利多卡因標準品    137-58-6     250mg    Lidocaine 
利福布丁標準品    72559-06-9     50mg    Rifabutin
利福平標準品    13292-46-1     300mg    Rifampin 
利福平醌標準品    13983-13-6     25mg    Rifampin Quinone 
利魯唑標準品    1744-22-5     200mg    Riluzole 
利魯唑相關物質A標準品    461-82-5     25mg    Riluzole Related Compound A
利奈孕醇標準品    52-76-6     20mg    Lynestrenol
利尿酸標準品    58-54-8    200mg    Ethacrynic Acid
細胞株

 

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